Norwegian AI Directory
Description:
I løpet av 2021 har NOI fortsatt å forbedre sin B-celleepitop prediktor. NOI har utviklet «negative data» ved hjelp av ulike fremgangsmåter - noe som utgjør en stor utfordring innen feltet, siden metoder som benyttes for å identifisere og validere B-celleepitoper kun identifiserer positive epitoper, og ikke negative epitoper. NOI har også fortsatt å optimalisere treningsfunksjonene og parameterne for å forbedre predikeringsevnen til programmet. Den forbedrede B-celleepitop prediktoren har blitt benchmarked, og i sammenlikning med 19 andre publiserte prediktorer kom den svært gunstig ut av det ved analyse av uavhengig testdata. Videre har tester nylig utført på COVID-19 spikeprotein vist at algoritmen predikerte 154 av 156 validerte spikeprotein epitoper med en TPR lik 0.987 - noe som viser ypperlig predikeringsevne. NOI har benyttet B-celleepitop prediktoren til å analysere omtrent 3400 drivermutasjoner i 299 kreftdrivergener. For hver drivermutasjon, ble tusener av mulige antistoff/epitop permutasjoner identifisert og analysert. Den fullstendige analysen resulterte i en database av antatte kreftdriverepitoper som kan benyttes til design av skreddersydde bibliotek for antistoff/epitop screeninganalyser. Drivermutasjonene skal nå valideres i Professor Ola Myklebost's laboratorium ved Universitetet i Bergen, for å identifisere epitoper som kan benyttes i utviklingen av en ny form for kreftdiagnostikk basert på flytende biopsier.
Project leader: Trevor Clancy
Started: 2018
Ends: 2022
Category: Næringsliv
Sector: Næringsliv
Budget: 9417340
Institution: NEC ONCOIMMUNITY AS
Address: NA